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果膠酶包括兩類，一類能催化果膠解聚，另一類能催化果膠分子中的酯水解。其中催化果膠物質解聚的酶分為作用于果膠的酶（聚甲基半乳糖、醛酸酶、醛酸裂解酶或者果膠裂解酶）和作用于果膠酸的酶（聚半乳糖醛酸酶、聚半乳糖醛酸裂解酶或者果膠酸裂解酶）。催化果膠分子中酯水解的酶有果膠酯酶和果膠酰基水解酶  。

性狀：一般為灰白色粉末，或棕黃色液體。商業用果膠酶的有效成分主要有三種酶。一種是果膠甲酯酶(Pectinpectylhydrolase)(EC3.1.1.11)，主要作用為催化甲酯果膠以脫去甲酯基，產生聚半乳糖醛酸苷鍵

果膠酶能破壞果汁中的懸浮物的穩定性，使其凝聚沉淀，得到澄清果汁；

果膠酶處理超濾膜能提高果汁超濾的通量，縮短超濾時間；

經果膠酶處理的果汁比較穩定，濃縮后不再發生渾濁；

在葡萄酒釀造中加入果膠酶能起到提高葡萄酒得率、澄清效果和過濾速度作用