即用型易錯PCR試劑盒-KLANG
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即用型易錯PCR試劑盒
產品特點:制突變PCR易錯 PCR(error-prone PCR)是利用 Taq DNA 多聚酶不具有 3′→5′校對功能的特性,在一定條件下(如不同的 dNTP 濃度、Mg 濃度和 MnCl2存在)能夠按較高的機率引入隨機引入突變。如果有適當的選擇方法,則可從構建的突變庫選出所需突變體。易錯 PCR 和常規 PCR 的比較如下:本產品就是專門為廣大的研究工作者進行易錯 PCR 而開發,本產品具有下列特點:
1. 即開即用,十分簡單方便,尤其在生物制藥和酶學研究領域顯示出了它的優越性。
2. 配方經過精心優化,突變率穩定,突變沒有趨向性。易錯 PCR 的突變率為 0.66%(±0.13%),詳見使用手冊疑難解答。
3. 比體內基因突變更快捷簡單,但如果在 PCR 引物中設計位點,則可使產物克隆到表達載體,也可以用于體內蛋白活性的篩選。
4. 可用于連續易錯 PCR(sequential error-prone PCR),只需把上一次易錯 PCR 的產物用作下一次易錯 PCR 的模板即可,使每一次獲得的小突變累積而產生重要的有益突變。
5. 只適用于擴增 1kb 以下的產物,對于 1kb 以上的產物,建議分段擴增。
6. 本產品足夠 100 次 30uL 體系的易錯 PCR 反應,只能用于科研。
規格及成分 成 份 編 號 十孔盒包裝
易錯 PCR Mix,10× LM101005a 300 uL(白蓋)
易錯 PCR 專用 dNTP,10× LM101005b 300 uL(綠蓋)
易錯 PCR 專用 MnCl2 LM160903c 300 uL(黃蓋)
易錯 PCR 專用
Taq DNA 聚合酶(5U/uL)
101005c 50 uL(紅蓋)
使用手冊 101005sc 1 份
運輸及保存 低溫運輸,-20℃保存, 有效期為一年。
自備試劑 引物、DNA 模板、超純水。
使用方法 1. 將自備的 PCR 引物稀釋到 10uM。引物也是決定易錯 PCR 成敗的關鍵因素,設計引物時要保證其 Tm 在 70℃,長度在 25-30nt 之間,GC 含量在 45%-60%之間,3端 GC 含量低,并且沒有發夾結構。用自備引物和常規 PCR 試劑擴增制備易錯 DNA 模板(常規 PCR 產物),膠回收并準確確定濃度。注意:易錯 PCR 的模板一定要用膠回收的常規 PCR 產物,因為膠回收會可以把電泳不可見的非特異性擴增片段去除,否則這些片段由于也是用易錯 PCR引物擴增所得,在易錯 PCR 擴增時也會被擴增,產生競爭抑制,降低靶分子的擴增效率。如果常規 PCR 制備模板的引物和易錯 PCR 引物不同(類似巢式 PCR)則可以避免此問題,但需要合成兩對引物。本試劑盒只適用于擴增 1kb 以下的產物,對于1kb 以上的產物,建議分段擴增。
2. 將回收的 DNA 片段(模板)稀釋到 1ng/uL 、10ng/uL 和 100ng/uL 三個濃度。
注意:模板使用量是影響突變率的最重要因素,模板 DNA 為非突變 DNA,擴增產生的 DNA 為突變 DNA,易錯 PCR 體系最終 DNA 量是基本固定的,因此模板 DNA 使用量越大,則突變 DNA 在終產物中的相對比例就越低,突變率就越低。反之亦然。但模板太少又不容易擴增成功,所以建議同時測試三個模板用量。如果都成功,則優先選用模板濃度低的 PCR 產物進行分析。
3. 以 30 uL 的標準 PCR 反應體系為例,如果反應體系不是 30 uL,各成分需要等按比例增加或減少。在一干凈的 PCR 管中,加入下列成分:成分 模板用量 1 模板用量 2 模板用量 3
易錯 PCR Mix, 10× 3 uL 3 uL 3 uL
自備 DNA 模板 1 uL(1ng/uL)1 uL(10ng/uL)1 uL(100ng/uL)
易錯 PCR 專用 dNTP,10×3 uL 3 uL 3 uL
易錯 PCR 專用 MnCl2 3 uL 3 uL 3 uL自備易錯 PCR 引物(10 uM each)各 1 uL 各 1 uL 各 1 uL
易錯 PCR 專用 Taq
DNA 聚合酶(5U/uL)
0.5 uL 0.5 uL 0.5 uL
補自備超純水到 30 uL 30 uL 30 uL
4. 按用戶已經優化的 PCR 條件進行一定循環數的 PCR(循環數與突變率的關系見下表),然后取 10uL 電泳檢查。如果沒有優化的 PCR 條件,一般可以先嘗試下面的PCR 條件(注意:易錯 PCR 一般不需要熱啟動,也不需要在 PCR 結束后做延伸處理):
步驟 參數 循環數
PCR 前變性 94℃ 3 分鐘 循環 1 次
易錯 PCR
94℃ 1 分鐘
45℃ 1 分鐘 循環 30-60 次
72℃ 1 分鐘
注:易錯 PCR 一般不需要熱啟動,也不需要在易錯 PCR 結束后做延伸處理。易錯 PCR
循環次數越多,突變 DNA(擴增產物)與非突變 DNA(原始模板)的比例就越高。此外
在突變率和模板長度恒定的情況下,擴增次數越多,發生突變的數就越高,在同一模
板上發生的突變位點數就越多,所以如果需要,可以做 30、35、40、45、50、55、60
次 7 個循環數的比較。
5. 電泳檢測是否得到預計長度的 PCR 產物。如果沒有,可以調整模板用量和 PCR 參數。
6. 膠回收易錯 PCR 擴增產物、克隆并對單菌落進行功能篩選或測序分析、如果需要增加突變率,可以以突變后的 DNA 為模板,進行下一輪易錯 PCR。