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用于生化研究和營養增補劑，也用于肺炎、肝硬變及脂肪肝等的輔助治療。

可作飼料添加劑。

氨基酸類藥、營養增補劑。用于肝硬變及脂肪肝。此外大量用作飼料添加劑，以改善飼料質量，提高天然蛋白質的利用率和促進動物的發育。如DL-蛋氨酸可提高雞的產蛋量，使生豬體重增加，奶牛多產奶等。不良反應：肝昏迷忌用。

蛋氨酸還是一種有力的抗氧化劑。它所含的硫能清除自由基。身體細胞內的核酸、膠原與蛋白質的合成都需要蛋氨酸。對服用避孕劑的婦女，服用蛋氨酸也有好處。由于它能降低體內組胺的水平，因此對治療精神分裂癥有效，因為精神分裂癥患者血中的組胺水平比正常人要高很多。如果體內的有毒物質增加，對蛋氨酸的需要也增加。因為身體能將蛋氨酸轉變為胱氨酸，胱氨酸是谷胱甘肽的前體，而谷胱甘肽是肝G臟的主要的有毒物質中和劑。這樣便能保護肝G臟不被有毒物質傷害。