辨別方法一：看桿莖

牡丹的莖為木質，落葉之后，有一部分是不會枯萎的，芍藥的莖是草質的，落葉會后地上部分就枯萎了。這是二者的本質區別，一個草本一個木本，一看莖就知道。

辨別方法二：看花型

牡丹的花都是獨朵頂生，花型大；而芍藥的花則一朵或數多頂生，花型比較小。

辨別方法三：看葉子

牡丹葉子表面綠色中略帶黃色，無毛，下面有粉末狀東西；芍藥葉子表面有濃綠色且葉子比較密。

辨別方法四：看花開期

牡丹在3月開花，芍藥則在春末夏初開花，也可以從開花期判斷哪個是牡丹哪個是芍藥。